微生物酶用于纺织牛仔面料的整理有利于环境保护。这是因为，第一，这些酶都是天然的非致病性微生物，其自身可迅速生物出降解，因此不会引起废弃物的积累；第二，在工业发酵生产工艺中，主要废弃物的发酵生物量，可以作为一种有机肥料，再循环用在周围环境中。
        用于纺织牛仔面料整理的微生物酶主要有两类，一类是淀粉酶，即降解淀粉的酶，用于退浆工艺；另一类是纤维素酶，即降解纤维素的酶，这是一种带有在纤维素的葡萄糖键上起特殊催化作用的蛋白质，其酶分子要比水份子大1000倍以上，因此它不能渗透到棉纤维的内部，水解仅在纤维素的表面进行，不会对牛仔面料造成严重的损伤。
        酶应用于牛仔服装的整理，其工艺步骤可分两步进行，即酶退浆和酶石洗。在退浆工艺中，淀粉酶可有效的去除牛仔面料上的浆料，防止产生条痕疵点，提高服装正品率。应用酶进行石洗称之为生物石洗，即用酶取代浮石，免除了繁重的搬运、储藏、处理浮石的劳动。浮石处理沾污服装、污染车间地面及下水道的问题也就不复存在。
        一、生物酶退浆工艺
淀粉酶作用于浆料中的淀粉部分，使长链和不溶性的淀粉分子降解成小的链段以致易于溶解而被去除。一般工艺条件是：
         淀粉酶浓度1-2g/L,pH值6-7，温度55-65C，时间10-15min，浴比1：10以上，并可使水洗机的翻滚速度降低，有利减少机械摩擦和条痕疵点的产生。
        二、生物酶石洗工艺
纤维素生物酶作用于棉纱线，使纱线表面纤维水解，从而使表面靛蓝染色层变松，然后在机械摩擦作用下很容易地被除去，达到用浮石磨洗同样的效果。一般工艺条件是：
        纤维素酶用量，中性酶为每千克服装需用10-15g，酸性酶每千克服装用20-30g,当酶与浮石结合应用时，则用量可降低50%；中性酶pH值应控制在6-7，酸性酶控制在4-5；温度45-55C；浴比1：5左右，时间根据服装需要控制在40-120min之间。